（RE-15448）マウス由来RNAを用いたSMART-Seq解析【掲載期間：2021年10月27日～2021年11月23日】

（RE-15448） マウス由来RNAを用いたSMART-Seq解析【掲載期間：2021年10月27日～2021年11月23日】 公告期間： ～()に付します。 1．競争入札に付する事項仕様書のとおり２．入札書等の提出場所等入札説明書等の交付場所及び問い合わせ先(ダイヤルイン)入札説明書等の交付方法上記２．(1)に記載の交付場所または電子メールにより交付する。 ただし、交付は土曜,日曜,祝日及び年末年始(12月29日～1月3日)を除く平日に行う。 電子メールでの交付希望の場合は、「 公告日,入札件名,当機構担当者名,貴社名,住所,担当者所属,氏名,電話,FAX,E-Mail 」を記載し、上記２．(1)のｱﾄﾞﾚｽに送信。 交付の受付期限は 17:00までとする。 入札説明会の日時及び場所開札の日時並びに場所３．競争に参加する者に必要な資格財務部契約課令和3年11月25日nyuusatsu_qst@qst.go.jp和泉 圭紀ＦＡＸ 043-251-7979(2)件名内容(4)R3.11.23入札公告マウス由来RNAを用いたSMART-Seq解析令和4年3月28日043-206-3014履行場所履行期限(木)千葉県千葉市稲毛区穴川４丁目９番１号財務部長国立研究開発法人 量子科学技術研究開発機構(火) 令和3年11月23日実施しない入札事務室11時00分請負令和3年10月27日本部(千葉地区)仕様書のとおり伊南 恵介(4)入札に必要な書類の提出期限令和3年11月24日(水) 17時00分(3)(2)R3.10.27(5)本部(千葉地区)(3)記一般競争入札(1)下記のとおり〒263-8555E-mail：ＴＥＬ(1)当機構から指名停止措置を受けている期間中の者でないこと。 全省庁統一競争入札参加資格を有する者であること。 当機構が別に指定する誓約書に暴力団等に該当しない旨の誓約をできること。 ４．入札保証金及び契約保証金 免除５．入札の無効入札参加に必要な資格のない者のした入札入札の条件に違反した者の入札６．契約書等作成の要否 要７．落札者の決定方法８．その他その他、詳細については、入札説明書によるため、必ず上記２．(2)により、 入札説明書の交付を受けること。 17:00までに中に当機構ホームページにおいて掲載する。 以上 公告する。 (2) 落札決定に当っては、入札書に記載した金額に当該金額の10パーセントに相当する額を加算した金額(当該金額に1円未満の端数があるときは、その端数を切り捨てた金額とする)をもって落札価格とするので、入札者は、消費税に係る課税事業者であるか免税事業者であるかを問わず、見積もった金額の110分の100に相当する金額を入札書に記載すること。 (2)(1)(4) 令和3年11月4日 (木)令和3年11月18日上記問い合わせ先宛てに質問書を提出すること。 なお、質問に対する回答は(木)本入札に関して質問がある場合には 予定価格の制限の範囲内で、最低価格をもって有効な入札を行った入札者を落札者とする。 (最低価格落札方式)国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構 契約事務取扱細則第10条の規定に該当しない者であること。 ただし、未成年者、被保佐人又は被補助人であって、契約締結のために必要な同意を得ている者についてはこの限りでない。 (1)(5)(4)(1)(2)(3)(1)国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構 契約事務取扱細則第11条第１項の規定に該当しない者であること。 (2)(3)前項の誓約書を提出せず、又は虚偽の誓約をし、若しくは誓約書に反することとなったときは、当該者の入札を無効とするものとする。 この入札に参加を希望する者は、入札書の提出時に、当機構が別に指定する暴力団等に該当しない旨の誓約書を提出しなければならない。 仕 様 書1. 件名：マウス由来RNAを用いたSMART-Seq解析2. 数量：一件3. 目的：神経変性疾患病態における免疫担当細胞のトランスクリプトーム解析のため。 4. 納入期限：令和4年3月28日5. 納入場所： 千葉県千葉市稲毛区穴川４－９－１国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構 量子生命・医学部門量子医科学研究所 探索研究棟3階6. 仕様・性能：以下の仕様を満たすこと。 ・供与サンプルの品質を電気泳動および濃度測定により確認する。 ・SMART法を用いてTotal RNA由来の完全長二本鎖DNAを合成する。 ・トランスポゾンを用いたタグメンテーション反応により、増幅された二本鎖cDNAの断片化および両末端へのアダプター配列の付加を行い、シーケンスの鋳型となるDNAライブラリーを作製する。 ・DNAライブラリーを混合する。 ・イルミナ社シーケンサーを用いて、シーケンスを行い、シーケンサー付属のソフトウェアにより塩基配列(リード配列)を得る。 ・タグ配列に基づき塩基配列(リード配列)を分類する。 ・配列データを参照ゲノムにマッピングする。 ・マッピング結果から、遺伝子ごとに正規化された発現量(TPM値)を算出する。 ・RNA増幅は、SMART-Seq v4 Ultra Low Input RNA Kit for Sequencingを用いて行う。 ・DNAライブラリー作製には、Nextera XT DNA Library Prep Kitを用いる。 ・NovaSeq システム(イルミナ社)を用いて、150base両末端解析(1件あたりの目安データ量6Gb/4,000万リード相当)を合計30件実施する。 ・遺伝子発現解析に用いるゲノム配列、遺伝子アノテーションファイルは、GENCODEから取得する。 ・塩基配列(リード配列)のファイルはFASTQ形式とする。 ・発現量などを求めた解析結果ファイルは、EXCELで閲覧可能な形式とする。 7. 検査条件： 納入時、当機構職員が、所定の要件を満たしていることを確認したことをもって検査合格とする。 8. その他： 1)本仕様書に記載されている事項及び本仕様書に記載のない事項について疑義が生じた場合は、協議のうえ、その決定に従う。 2)納入後１年以内に、当機構の責によらず装置に不具合が生じた場合、速やかに物品交換や修理を無償で行うこと。 (要求者)部課(室)名：脳機能イメージング研究部氏名： 高堂 裕平小野 麻衣子