（一般競争入札公告）ショートリードによる調整済みライブラリーシーケンス（25B）（単価契約）

（一般競争入札公告） ショートリードによる調整済みライブラリーシーケンス（25B） （単価契約） （一般競争入札公告） ショートリードによる調整済みライブラリーシーケンス（25B） （単価契約） 下記のとおり一般競争入札に付します。 入札説明書類（10943KB） 質疑書・担当者連絡先（73KB） 適合証明書（20KB） 契約担当役 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 理事長 中村 祐輔 記 １．契約件名等 １） 契約件名 ショートリードによる調整済みライブラリーシーケンス（25B)（単価契約） ２） 仕様等 入札説明書による。 ３） 契約期間 自：契約締結日 至：令和8年3月31日 ４） 納入場所 大阪府茨木市彩都あさぎ7丁目6番8号 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 難病・免疫ゲノム研究センター ５） 入札方法 入札金額は、1検体あたりの単価で行う。 なお、落札決定に当たっては、入札書に記載された金額に当該金額の10パーセントに相当する額を加算した金額（当該金額に1円未満の端数があるときは、その端数金額を切り捨てるものとする。 ） をもって落札価格とするので、入札者は、消費税に係る課税事業者であるか免税事業者であるかを問わず、見積もった契約金額の110分の100に相当する金額を入札書に記載すること。 ２．競争参加資格 １） 契約事務取扱要領第4条及び第5条の規定に該当しない者であること。 ２） 令和7・8・9年度厚生労働省一般競争参加資格（全省庁統一資格） 「役務の提供」のＡ～Ｄのいずれかの等級に格付けされている者であること。 ３） 当該役務物品を確実に納入できると認められる体制等を有している者であること。 ４） 資格審査申請書又は添付書類に虚偽の事実を記載していないと認められる者であること。 ５） 経営の状況又は信用度が極度に悪化していないと認められる者であること。 ６） その他契約事務取扱要領第3条の規定に基づき、契約担当役が定める資格を有する者であること。 ７） 公益法人においては、「政府関連公益法人の徹底的な見直しについて」（平成21年12月25日閣議決定） の内容について問題がない者であること。 ８） 暴力団が実質的に経営を支配する者又はこれに準ずる者に該当しないこと。 ９） 法人格を持つ事業体であること。 さらに、消費税及び地方消費税並びに法人税について、納付期限を過ぎた未納税額がないこと。 10） 「個人情報の保護に関する法律」（平成15年法律第57号） を遵守し、個人情報の適切な管理能力を有していること。 11)社会保険（厚生年金保険、健康保険（全国健康保険協会が管掌するもの） 、船員保険、国民年金、労働者災害補償保険及び雇用保険をいう。 ） に加入し、該当する制度の保険料の滞納がないこと。 ３．入札書の提出場所等 １） 入札書の提出場所、入札説明書の交付場所及び問い合わせ先 〒567−0085 大阪府茨木市彩都あさぎ7丁目6番8号 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 総務部会計課契約係 電話：072−641−9860 ２） 入札説明書の交付方法 本公告の日より弊所ホームページ調達情報（ https://www.nibn.go.jp/procurement/ ） 又は上記３．１） の交付場所にて交付する。 ３） 入札書の受領期限 令和７年８月５日（火） １７時００分 （郵送の場合も同様） ４） 開札の日時及び場所 令和７年８月６日（水） １４時００分 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 第二会議室 ４．その他 １） 契約手続において使用する言語及び通貨 日本語及び日本国通貨に限る。 ２） 入札保証金及び契約保証金全額免除 ３） 入札の無効 本公告に示した競争参加資格のない者の提出した入札書、入札者に求められる義務を履行しなかった者の提出した入札書又はその他入札の条件に違反した入札は無効とする。 ４） 契約書作成の要否 要 ５） 落札者の決定方法 本公告に示した役務を実施できると契約担当役が判断した入札書を提出した入札者であって、会計規程第41条及び契約事務取扱要領第16条第1項の規定に基づいて作成された予定価格の制限の範囲内で最低価格をもって有効な入札を行った入札者を落札者とする。 ６） 詳細は入札説明書による。 単価契約仕様書1． 調達件名ショートリードによる調製済みライブラリーシーケンス(25B)2． 調達目的動物検体またはヒト由来検体を用いた転写産物等の配列解析を行う。 その際の多検体の調製済みライブラリーシーケンス解析に本解析が必要であるため。 3． 医薬基盤・健康・栄養研究所(以下「当所」という。 )からの供与物調製済みライブラリープール・5 nM 以上、40 µL以上 /レーン・-20℃の温度管理便(ドライアイス梱包)にて当所から解析機関へ輸送する。 4． 仕様(作業内容)受託者は、当所が提供する調製済みライブラリーを用いてレーン貸切のシーケンスを行う。 作業内容詳細は以下のとおりとする。 ・ 供与サンプルの品質を濃度測定などにより確認する。 ・ (米)イルミナ社NovaSeq X Series 25B Reagent Kit (300 cycles) にてシーケンスを行う。 解析の条件はシーケンスセッティング： 150PE、アウトプット： 65億ペアエンドリード相当、1000Gb /レーン相当とする。 ・ タグ配列に基づきシーケンスデータを分類して納品すること。 5． 業務の管理(１)受託者は、本業務の実施に当たり､業務履行責任者を定めること。 (２)本業務は、専門的な知識及び実務経験を有する者が行うこと。 作業内容が正確に行われることを担保するために、作業施設は、定期的な装置の保守(月に 1 回以上)、装置運用の頻度(月に 1 回以上)、検体の取違防止の手順の確立と十分な人員配置(2 名以上)、人員に対する教育(1 年 1 回以上)及び精確な解析を行うために必要な操作毎の液量確認といった実験作業上の手順を履行している施設であること。 (３)受託者は、本業務の実施に当たり、情報漏洩防止の管理を徹底すること。 また、今回の業務は極めて個人的な情報を扱うことから、作業施設は日本国内の施設であること。 解析データは外部ネットワークから独立した区画で、データ漏洩を防止する対策を行い、管理すること。 (４)当所から委託業務の実施状況に関して問い合わせがあった場合、書面または口頭による報告を、2日以内(ただし、土曜日、日曜日、国民の祝日に関する法律第3条に規定する休日及び年末年始(12月29日から1月3日)は除く。 )に行うことができること。 更に、貴重試料の取扱いで問題が発生した場合、要望に応じて、当所が作業工程の確認及び査察対応が可能であること。 (５)サンプルの取り間違いを防ぐため、受託者の担当者が研究室にて直接確認をしたうえで、回収すること。 6． 納入場所大阪府茨木市彩都あさぎ７－６－８国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所難病・免疫ゲノム研究センター7． 納入期限サンプルの品質検査を通過した後、約4～8週間以内とする。 ただし，やむを得ない事情により前途の納入が困難であることが予め見込まれる場合は，サンプル送付時に別途協議するものとする。 8． 予定数量(予定数量であって、確定購入数でない)15検体(調製済みライブラリープール)9． 契約期間契約締結日から令和８年３月３１日10． 成果物・受託者は、当所の指定する数量の検体解析業務終了毎に、試験報告書として納入場所に電子媒体で報告すること。 なお、電子媒体の費用を含む、納入に関する一切の費用は受託者が負担すること。 ・当所による試験報告書の検査終了後、受託者は請求書を発行すること。 ・解析結果シーケンスデータのファイルは FASTQ 形式とし、セキュリティ対策を施した暗証番号認証ストレージに記録し返却すること。 なお、ストレージサイズは、納入都度データ量に応じて決定する。 11． 受託要件受託者は以下の条件を全て満たすこと。 また、資格に関しては証明書等の提出を行うこと。 (１)解析情報の拡散リスクを減少するため、提供物量を極力減らすため、また均一な品質のデータを得るために、受託者は全作業を国内の同一施設内にて完了すること。 (２)納品データおよび提供サンプルは送付日を基準として3ヶ月間のみ保管すること。 (３)納期や実験進行に支障が発生した場合は、当所担当者と相談すること。 また、迅速に相談できる体制が構築済みであること。 (４)サンプルの受け渡し、解析方法の詳細については、当所担当者と事前に協議を行い互いに納得した上で業務を行うこと。 (５)当所が希望すれば、提供サンプルを返送可能であること。 (６)サンプル返送費用については当所が負担すること。 (７)受託解析機関は、衛生検査所登録、および臨床検査ラボの品質管理における世界基準の一つであるCAP(米国病理学会：College of AmericanPathologists)によるLAP(臨床検査室認定プログラム：LaboratoryAccreditation Program)の認定を取得し、適切な品質・精度管理の下、業務を実施すること。 (８)Novaseq X Plus 1台以上を運用する設備が整っていること。 また、不測の事態へのバックアップとして、受託者は国内で衛生検査所の登録承認を持つ自社の別施設にてNovaSeqを保有しており、他のシーケンスサービス(修理及びサポート)を実施できる体制が整備されていること。 (９)本仕様と同様の作業実績があり、サンプル品質、データ量、データ品質検査の経過等の実績を当所担当者に報告することが可能であること。 (１０)個人情報保護方針に基づいて、得られたシーケンス解析データやその他の情報を、他の目的で使用および第三者へ提供しないこと。 (１１)解析責任者として、5年以上の実務経験を有するものを配置すること。 (１２)代理店が受託者となる場合は、解析担当業者が上記の要件を満たすこと。 12． 守秘義務受託者は、本業務上、当所より開示され又は提供された検体に附帯する情報(以下「秘密情報」という。 )について守秘義務を負うこととし、以下の要件を遵守すること。 (１)本業務で知り得た業務上の秘密情報は､第三者に開示しないこと。 (２)本業務で知り得た業務上の秘密情報は､本業務の目的以外で使用しないこと。 (３)上記の他情報の取り扱いについては、逐次当所に確認すること。 (４)代理店が応札する場合には、解析担当業者にのみ秘密情報を開示するため、解析担当業者が上記要件を遵守すること。 13．その他(１)本仕様に記載のない事項及び仕様書に疑義が生じた場合は､速やかに当所と連絡を取り､両者協議の上取り決めるものとすること。 (２)提供したゲノムDNA検体の残余分については、受託者の責任の下、適切な廃棄・処分を行い、当所が希望した場合は廃棄証明書を発行し提出すること。 (３)本業務により得られた成果物である報告書の著作権は、当所に帰属するものとする。 (４)検体の品質確認の結果解析が実施できない場合は、所定のキャンセル料(具体的には品質確認までに費消した費用)について、両者協議の上取り決めるものとすること。 以上契 約 書１．件 名 ショートリードによる調製済みライブラリーシーケンス(25B)(単価契約)２．納入場所 大阪府茨木市彩都あさぎ７―６―８国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所難病・免疫ゲノム研究センター３．契約期間 自 契約締結日至 令和８年３月３１日４．契約単価 １検体あたり 金 円(税抜)(消費税額及び地方消費税額については、検体数量に契約単価を乗じた金額に１０％を乗じて得た金額とする。 )５．契約保証金 全 額 免 除上記について、契約担当役 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 理事長中村 祐輔(以下「甲」という。 )と、【受注者】(以下「乙」という。 )とは、次の条項により請負契約を締結する。 (信義誠実の原則)第１条 甲、乙両者は、信義を重んじ誠実に本契約を履行しなければならない。 (総則)第２条 乙は、別添仕様書に基づき、頭書の請負金額をもって、頭書の期間中に業務を完全に履行しなければならない。 ２ この契約書及び仕様書等に定めのない事項については、甲乙協議して定める。 (再委託)第３条 乙は、本業務を自ら実施するものとし、甲の事前の書面による同意なくして、本業務の全部又は一部を第三者に再委託してはならない。 ２ 乙は、再委託する場合には、様式１により甲に再委託に係る承認申請書を提出し、その承認を受けなければならない。 ただし、当該再委託が５０万円未満の場合は、この限りではない。 ３ 乙は、委託業務の一部を再委託するときは、再委託した業務に伴う当該第三者(以下「再委託者」という。 )の行為について、甲に対し全ての責任を負うものとする。 ４ 乙は、委託業務の一部を再委託するときは、乙がこの契約を遵守するために必要な事項について本委託契約書を準用して、再委託者と約定しなければならない。 (再委託先の変更)第４条 乙は、再委託先を変更する場合、当該再委託が前条第２項ただし書に該当する場合を除き、様式２の再委託に係る変更承認申請書を甲に提出し、その承認を受けなければならない。 (履行体制)第５条 乙は、再委託の相手方からさらに第三者に委託が行われる場合には、当該第三者の商号又は名称及び住所並びに委託を行う業務の範囲を記載した別紙１の履行体制図を甲に提出しなければならない。 ２ 乙は、別紙１の履行体制図に変更があるときは、速やかに様式３により履行体制図変更届出書を甲に届け出なければならない。 ただし、次の各号の一に該当する場合については、届出を要しない。 一 受託業務の実施に参加する事業者(以下「事業参加者」という。 )の名称のみの変更の場合。 二 事業参加者の住所の変更のみの場合。 三 契約金額の変更のみの場合。 ３ 前項の場合において、甲は本契約の適正な履行の確保のため必要があると認めたときは、乙に対して変更の理由等の説明を求めることができる。 (特許権等の使用)第６条 乙は、業務の遂行に特許権等、第三者の権利の対象となっている施行方法を使用する場合には、その使用に関する一切の責任を負わなければならない。 (関係諸法令の遵守)第７条 乙は、実験動物関連の法令及び国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所の各種規程等を遵守し、その一切の責任を負わなければならない。 ２ 乙は、労働災害の発生に対して、その一切の責任をもたなければならない。 (貸与品、支給品の管理)第８条 乙は、貸与又は支給された物品等を善良なる管理者の注意をもって管理し、また使用しなければならない。 (管理物件に対する決定権)第９条 当該業務の遂行上生じる管理物件の消耗破損及び故障の修理は適宜乙がこれを行う。 御 社 代 表 者 印 ( ３ ヶ 所 )( 裏 面 )○○○株式会社入 札 辞 退 届件名： ショートリードによる調製済みライブラリーシーケンス(25B)(単価契約)上記の入札件名について、都合により辞退します。 令和 年 月 日契約担当役国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所理事長 中村 祐輔 殿入 札 者住 所氏 名(社 名)委任状私は、 を代理人と定め、下記のとおり委任いたします。 記委任事項令和７年８月６日開札 件名「ショートリードによる調製済みライブラリーシーケンス(25B)(単価契約)」の競争入札に関する一切の権限を委任いたします。 代 理 人氏 名 印令和 年 月 日委 任 者住 所商号又は名称代表者職氏名 印契約担当役国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所理事長 中村 祐輔 殿年 間 委 任 状私は、下記受任者を代理人と定め令和 年 月 日から令和 年 月日までの間における 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 との下記事項に関する権限を委任します。 記１．見積、入札及び契約の締結に関すること。 (契約の変更、解除に関することを含む)２．契約物件の納入及び取下げに関すること。 ３．契約代金の請求及び受領に関すること。 ４．復代理人を選任すること。 ５．共同企業体の結成及び結成後の共同企業体に関する上記各項の権限。 【工事契約以外の場合は除く】(ただし、３については、上記期間満了日の翌々月末までとする。 )令和 年 月 日契約担当役国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所理事長 中村 祐輔 殿委任者本社・本店所在地商号又は名称代表者職氏名 印受任者支店等所在地商号又は名称代表者職氏名 印